Используя данные о прибывающих рейсах из Соединенного Королевства и других стран, сильно пострадавших от варианта SARS-CoV-2 B.1.1.7, исследователи Йельской школы общественного здравоохранения впервые сообщили о количестве интродукций и степени распространения этого варианта. распространение, принадлежащее к этой линии в Соединенных Штатах.
Ученые использовали статистическое моделирование, чтобы спрогнозировать, что из-за большого количества пассажиров в крупных американских аэропортах в Нью-Йорке, Калифорнии, Флориде, Техасе, Нью-Джерси и Массачусетсе эти штаты сталкиваются с самыми высокими рисками ввоза вируса B.1.1.7. из Соединенного Королевства.
Авторы определили по крайней мере 23 различных места, где этот вариант был представлен и который к началу марта привел к устойчивой передаче вируса среди населения в девяти штатах США. Вариант сейчас есть во всех 50 штатах.
Было обнаружено, что к декабрю 2020 года вариант B.1.1.7, который считается более трансмиссивным и вирулентным, чем исходный вирус, вызвавший пандемию, уже установился и распространился внутри США. Исследователи использовали расширенный филогеографический анализ геномные данные для создания своих выводов.
«Выявление новых вызывающих озабоченность вариантов до того, как они станут доминирующими, является ключом к борьбе с этой пандемией», — сказала Тара Альперт, научный сотрудник Йельской школы общественного здравоохранения и ведущий автор исследования. «Наблюдение в таком масштабе требует обширного сотрудничества и партнерства, и мы благодарны за вклад нашей команды».
Результаты недавно опубликованы в журнале Cell .
Исследователи также использовали данные испытаний COVID-19 из соседних штатов (Коннектикут, Нью-Йорк, Нью-Джерси и Иллинойс), чтобы спрогнозировать экспоненциальный рост B.1.1.7 в штатах США с использованием модели логистического роста. По мере продолжения местных и международных поездок государства, менее оснащенные возможностями геномного надзора, могут не замечать появления и распространения вызывающих озабоченность вариантов.
Результаты исследования показывают, что в некоторых штатах необходимо значительно активизировать тестирование и секвенирование генома для обнаружения таких вариантов до начала всплеска.
Это исследование потребовало обширного сотрудничества между многими лабораториями Йельского университета и за его пределами для сбора образцов и секвенирования, а также для агрегирования и анализа данных.
«Необходимо было незамедлительно опубликовать наши результаты, чтобы помочь руководящим принципам и инициативам в области общественного здравоохранения наиболее эффективным способом», — сказал Андерсон Брито, также ведущий автор и научный сотрудник школы.
Поскольку SARS-CoV-2 заражает все больше людей, мутации могут приводить к более трансмиссивным вариантам, способным избежать нейтрализации антител или быть более вирулентными. Исследовательская группа Йельского университета продолжает сотрудничать с Центрами по контролю и профилактике заболеваний, а также с местными департаментами здравоохранения и больницами, чтобы отслеживать появление вариантов.
По мере развертывания вакцинации исследователи также исследуют случаи уклонения от вакцинации, потенциально вызванные существующими или новыми вариантами, которые могут появиться при повторном открытии штатов.
